Mikkeli a fővárostól, Helsinkitől 232 kilométerre található. A helyhatósági terület lakossága 2009 márciusában 48 702 fő volt, ebből nagyjából 34 000 fő élt a városban. A lakosság 97,7 százaléka finn anyanyelvű.
A város a Saimaa-tórendszer Savilahti nevű öblének környékén épült. Környékén több kis tó is található. A város keleti felén lévő tavak a Vuoski-folyó vízrendszeréhez, a tőle nyugatra található tavak a Puula-tóhoz tartoznak, ami a Kymijoki-folyó vízrendszerének része.
 
A város 2001-es Anttolával való összeolvadása, továbbá Haukivouri 2007-es csatlakozása után Mikkeli közigazgatási területe 2127,21 km². Ebből adódik, hogy Mikkeli területe nagyobb, mint Londoné. A terület nagy része azonban falusi képet mutat, ennek megfelelően a népsűrűség alacsony, 28.5 fő/négyzetkilométer.
 
Mikkeli szomszédos területei északon Pieksämäki, északkeleten Juva, délkeleten Puumala, délen Ristiina, délnyugaton Hirvensalmi és északnyugat felől Kangasniemi.

A székesegyház 1896 és 1897 között épült a kor legjelentősebb templomépítője, Josef Stenbäck tervei alapján. A vörös téglából épült templom jó példája a finnországi letisztult neogótikus építészetnek. A nyugati oldalán 64 méter magas harangtorony áll, ami ma is a város legmagasabb építménye. A templom a város evangélikus-lutheránus közösségét szolgálta, ami az 1897-es templomszentelést követően önállósodott a tartományi közösségtől. Miután a világháború befejeztével Viipuri (ma Viborg) Oroszországhoz került, Mikkelibe helyezték át a püspöki székhelyet. 1945 óta a templom ad helyet a mikkelii püspökségnek, amihez egész Délkelet-Finnország tartozik.

A háborús Mikkelit gyakran azonosítják Mannerheim marsallal, a finn hadsereg vezetőjével, Finnország későbbi elnökével. A parancsnoksága alatt használt személyi vasúti kocsija ma is a vasútállomáson áll. A nagyközönségnek csak évente egyszer nyitják meg, Mannerheim születésnapján, június 4-én, de az ablakán bárki benézhet. A vasúti kocsiban jött létre az Immola repülőtéren 1942-ben Mannerheim híres találkozója Hitlerrel, aminek bizalmas beszélgetését titokban rögzítették. A találkozón készült fotók a kocsiban láthatók.